Im Finale der Saga führt Thomas eine Gruppe entflohener Gladers auf ihrer gefährlichsten Mission an. Thomas und seine Freunde Minho, Newt und Teresa sind nun dahinter gekommen, dass sie nur als Versuchskaninchen dienten und dabei helfen sollten ein Heilmittel für eine tödliche Seuche zu finden. Nun liegt es der Hand der Teenager die Welt zu retten und von der Krankheit zu befreien. Dafür müssen sie in die letzte legendäre Stadt vordringen und das schwierigste Labyrinth meistern.